Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Elp3Q9CZX0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elp3Q9CZX0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms