Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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