Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms