Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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