Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spdl1Q923A2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spdl1Q923A2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spdl1Q923A2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spdl1Q923A2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spdl1Q923A2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spdl1Q923A2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms