Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms