Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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