Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms