Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eci3Q78JN3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Eci3Q78JN3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eci3Q78JN3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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