Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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