Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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