Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms