Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp18Q5SSI6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms