Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf3Q5HZG4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms