Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms