Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms