Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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