Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Spatc1Q148B6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spatc1Q148B6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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