Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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