Protein–RNA interactions for Protein: Q05920

Pc, Pyruvate carboxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcQ05920 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcQ05920 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcQ05920 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcQ05920 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcQ05920 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcQ05920 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcQ05920 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms