Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms