Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms