Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms