Protein–RNA interactions for Protein: P50714

Defa16, Alpha-defensin 16, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa16P50714 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa16P50714 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa16P50714 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms