Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms