Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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