Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms