Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VimP20152 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VimP20152 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VimP20152 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms