Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capns1O88456 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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