Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnk2O54967 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms