Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NmbrO54799 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NmbrO54799 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NmbrO54799 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbrO54799 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbrO54799 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbrO54799 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms