Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms