Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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