Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MttpO08601 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MttpO08601 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MttpO08601 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MttpO08601 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MttpO08601 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms