Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms