Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm10428J3QNV7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10428J3QNV7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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