Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms