Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms