Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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