Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ssxb8B1AY40 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ssxb8B1AY40 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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