Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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