Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrdcA0A0G2JEU3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms