Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms