Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms