Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms