Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms