Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms