Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D979 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D979 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D979 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D979 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D979 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D979 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms