Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necab3Q9D6J4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms