Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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